Впервые группа была определена Карлом Асмундом Рудольфи в 1808 году под именем Nematoidea. Позже группа была последовательно классифицирована как семейство Nematodes Бурмистром в 1837 году и как порядок Nematoda К. М. Дизингом в 1861 году.
Таксономический статус и систематическое положение некоторых групп нематод (классов, подклассов, отрядов) дискутируется. Например, по некоторым старым классификациям крупнейший класс Chromadorea принимали в узком объёме (без Ascaridida, Spirurida, Tylenchida) и включали в ранге отряда Chromadorida Chitwood, 1933 в состав сборного парафилетического подкласса нематод Аденофореи, или афазмидиевые (Adenophorea, Aphasmidia Chitwood et Chitwood, 1933). Впервые деление нематод на два подкласса в 1930-х годах обосновал Б. Читвуд (Chitwood B., 1933, 1937). Однако, предложенное им название Phasmidia Chitwood et Chitwood, 1933 оказалось преоккупировано (уже занято) старым сходным именем одного из отрядов насекомых и по законам таксономии потребовало замены. В большинстве работ XX века нематодологи использовали такие названия подклассов:
- Подкласс Adenophorea Linstow, 1905 (или Aphasmidia Chitwood et Chitwood, 1933) с отрядами Chromadorida (позднее разделённого на отряды Araeolaimida, Desmodorida, Desmoscolecida, Monhysterida) иEnoplida (Dorylaimida, Mermithida, Muspiceida, Trichocephalida)
- Подкласс Secernentea Linstow, 1905 (или Phasmidia Chitwood et Chitwood, 1933) первоначально только с двумя отрядами Rhabditida и Spirurida (затем они были раздроблены на Aphelenchida, Ascaridida, Camallanida, Diplogasterida, Rhabdiasida, Rhabditida, Spirurida, Strongylida, Tylenchida)
Искусственность такого классического взгляда на систематику нематод (особенно Adenophorea) всё более подтверждали новые анатомические и молекулярно-генетические исследования. В некоторых более поздних системах, где все нематоды рассматриваются в ранге класса, выделяют 3 подкласса (Малахов, 1986).
- Подкласс Enoplea (Dorylaimida, Enoplida, Marimermithida, Mermithida, Mononchida, Trichocephalida)
- Подкласс Chromadoria (Araeolaimida, Chromadorida, Desmoscolecida, Desmodorida, Monhysterida, Plectida)
- Подкласс Rhabditia (Ascaridida, Oxyurida, Rhabditida, Spirurida, Strongylida, Tylenchida)
Современная классификация
По данным на 2011 год (Hodda, 2011), тип Нематоды включает 3 класса, 31 отряд, 267 семейств, 2829 родов и 24 783 вида, причём ископаемые таксоны представлены в 2 родах 10 видами; есть также 7 родов и 7 видов, известных только в ископаемом состоянии (ранее высказывались оценки от 15 до 80 тысяч, а реальное разнообразие нематод — с учётом перспектив описания новых видов — оценивается в миллион видов).
Тип включает три класса и около 30 отрядов:
- Тип: Nematoda
- Класс: Chromadorea
- Отряд: Benthimermithida
- Отряд: Chromadorida
- Отряд: Desmodorida
- Отряд: Desmoscolecida
- Отряд: Diplogasterida
- Отряд: Drilonematida
- Отряд: Leptolaimida
- Отряд: Monhysterida (вкл. Araeolaimida)
- Отряд: Panagrolaimida (вкл. Tylenchina)
- Отряд: Plectida
- Отряд: Rhabditida, включает большинство крупных паразитов позвоночных, а также модельную нематоду Caenorhabditis elegans
- Отряд: Selachinematida
- Отряд: Spirurida (вкл. Ascaridina)
- Отряд: Teratocephalida
- Класс: Enoplea
- Отряд: Alaimida
- Отряд: Enoplida
- Отряд: Ironida
- Отряд: Isolaimida
- Отряд: Oncholaimida
- Отряд: Rhaptothyreida
- Отряд: Stichosomida
- Отряд: Trefusiida
- Отряд: Triplonchida
- Отряд: Tripylida
- Отряд: Tripyloidida
- Класс: Dorylaimea (или подкласс в Enoplea)
- Отряд: Bathyodontida
- Отряд: Dioctophymatida — как правило, крупные нематоды, паразитирующие в кишечнике, желудке и почках млекопитающих и птиц.
- Отряд: Dorylaimida — свободно движущиеся морские, пресноводные и почвенные нематоды
- Отряд: Marimermithida
- Отряд: Mermithida (в том числе паразиты беспозвоночных из семейства Mermithidae)
- Отряд: Mononchida
- Отряд: Muspiceida
- Отряд: Trichocephalida — паразиты позвоночных животных (включая широко распространённых паразитов из родов трихинелла и власоглав)
- Класс: Chromadorea
